Alors pour acheter des mangas: toute bonne librairie BD, ou tout simplement Fnac (mais se posera toujours le problème de savoir si ils commercialisent tous les éditeurs, car certains, comme Tonkam, ne diffusent leurs produits que dans une selection de magasins)
Pour les DVD et les goodies: même topo, les boutiques spécialisées dans les articles d'import japonais, la Fnac (ou autres). Après, tout dépend de la ville dans laquelle tu cherches... Dans les tres grandes villes, il n'y a pas de probleme, c'est facile a trouver.
Pour les boutiques où trouver de tout, sur Paris, pele-mêle, je peux citer Tonkam rue keller, Atomic a l'autre bout de la meme rue, ainsi que Mangarake pas tres loin, NewCityGames, et beaucoup d'autres (qui d'ailleurs font presque tous de la VPC).
Pour les dvd/K7 exclusivement, tu as le magasin de Manga-distribution (a noter qu'ils sont les fournisseurs de toutes les boutiques que tu trouvera ailleurs dans les pays francophones: ils sont a la fois editeur (label Declic Images), grossiste, et distributeur... ce qui explique que c'est souvent sur leur site www.manga-distribution.com que tu trouvera les meilleurs tarifs moyens pour un catalogue conséquent!)
Sinon effectivement la librairie Junku-Do à Pyramides est tres bien garnie, tout spécialement en VO.... certainement LA librairie japonaise en France (en tout cas, je n'ai pas encore vu mieux)
Sur Lyon, la librairie Glénat de la Part-Dieu est assez bien achalandée, sinon il existe plusieurs boutiques dans le quartier autour des Terreaux.
Je connais également des bonnes adresses dans d'autres villes (Aix en provence, Marseille, Lausanne, St Etienne, par exemple, mais je doute que ca interesse grand monde...)
Le plus simple pour la VPC est d'acheter un magazine spécialisé, comme AnimeLand, qui regorge de publicités de quasiment tous les grands VPCistes spécialisés Manga/Animation/Goodies/J-Music
Sinon, rends toi dans une convention (Japan expo, Epita, BD expo, Anim'est, etc..) il y en a souvent... tu trouvera de tout, en abondance, avec du choix car les stands presents sont généralement ceux des boutiques que j'ai citées et des éditeurs)
Pour Muramassa: Sur Nancy, les 2 bonnes adresses pour acheter de la BD en général, et du manga en particulier sont La Librairie du 9eme Art, rue Saint Nicolas, mais surtout La Parenthèse, dans la cour des Arts... personnelement, j'y suis connu comme le loup blanc (bon d'accord, vu ce que je leur laisse comme fric depuis des années, c'est pas étonnant)
Pour les approvisionnements, attention, je ne sais pas de quelle série tu parles (25 volumes? GTO peut etre?), mais il peut s'agir tout simplement de ruptures chez l'éditeur.. il arrive que certains volumes d'une série soient en rupture totale nationale... et dans ce cas, ne reste plus qu'a prier pour une réédition ! (ce qui veut dire parfois attendre plusieurs années... exemple: la réédition des premiers volumes de X-1999)
Toujours sur Nancy, pour l'animation, il n'y a pas grand chose... avant l'explosion du net, j'achetais beaucoup chez CyberSoft, mais je n'y suis pas retourné depuis plusieurs années, donc je ne sais pas ce qu'ils font actuellement... restent les rayons videos de la Fnac et du Hall du Livre, mais le plus simple, moins cher et mieux garni reste encore la VPC, malheureusement (ben oui, c'est bien beau de vouloir faire vivre les petits commerces de proximité, mais c'est pas toujours évident financierement quand on voit les differences de tarifs :s)
voila voila... en esperant avoir repondu a quelques attentes...