Que ce soit au Japon, en France ou dans n'importe quel pays, je conseille fortement de respecter l'adage "A Rome, faisons comme les romains". Cela est plus agréable à nos interlocuteurs du pays, mais aussi pour nous-mêmes, car nous ne changerons pas les habitudes locales, et nous ne recueillerons que de la frustration. Je ne pense pas qu'utiliser les pronoms masculins (pour une femme étrangère) fasse progresser d'un milimètre la condition des femmes au Japon. En plus, le fait qu'il y ait des pronoms masculins et féminins n'est pas en soi un signe d'inégalité des sexes, contrairement à la grammaire française, ou le masculin a la priorité sur le féminin dans les accords.
Gardez le non respect des coutumes pour les cas où cela vous est vraiment insupportable (partager un bain nu avec d'autres personnes, ou que sais-je encore?).